她们通悟了总纲后，开始修炼易筋锻骨篇，此篇为九阴真经起初的心法，练成后功力等方面均进展迅速，不但有打坐修炼的静功，也有由外而内的动功。

接着修炼疗伤篇，疗伤篇系为疗伤之用，亦能用以增加功力。

接下修炼轻功篇，螺旋九影集身法、步法、罡气于一体，可平地拔起数丈，亦可平空飞行千里，练之上乘可幻化出九个身影，于佛门无上神功“莲台九现”有相同的功效，如加九阴白骨爪其威力可增十倍。诀曰：左转一，左转半。右转一，右转半。左右转一为不一，横空旋较为太一。诀曰：左旋右旋天地旋，左踏右空平地旋。合手阴阳为上旋，右踏左空旋不为。虽为身法，实含玄理。

然后修炼九阴神抓，也就是九阴白骨爪，这套武功是最为广为人知道的九阴真经武功。

九阴白骨爪是铁尸梅超风和铜尸陈玄风夫妇根据《九阴真经》下半部练就的阴毒武技，以十指摧骨破骨，狠辣无比，而在《九阴真经》中，此招叫做“九阴神抓”，使用时“五指发劲，无坚不破，摧敌首脑，如穿腐土。”

梅、陈二人学不到《九阴真经》上半部中养气归元、修习内功的心法，但凭已意，胡乱揣摸，不知“摧敌首脑”是攻敌要害之意，以为是以五指去插入敌人头盖，又以为练功时必须如此，硬是把上乘武功练到了邪路上。峨眉派掌门周芷若为求速成，亦练得此功，夺得武功天下第一的名头。

此功由于多用手指在人头上插出五洞，极度血腥，故被视为邪功，其实九阴白骨爪根本没有那么邪乎，纯粹是黑风双煞错误理解九阴白骨爪的“五指发劲，无坚不破，摧敌首脑，如穿腐土”而错练正派武学为邪功。

《九阴真经》上下部合起来，养气归元，以内功驱动指法练成九阴神抓，施展起来的状态跟鹰爪功一样普通，实质上威力更强，爪力无比，其爪可使头骨成孔而不碎，爪指有强大的透劲可隔空伤人，一收一放，一开一合，合乎武学大道之理，但绝对不会阴风阵阵，腥气十足了。

修炼好九阴神抓后，再练摧心掌，中此掌者，外在并无任何伤痕，但内里的五脏六腑已然碎裂。

摧心掌与九阴白骨爪皆是记载于《九阴真经下卷》内的武功，属于外门武功，似乎无需《九阴真经上卷》内所记内功，即可修炼。桃花岛岛主黄药师门下弟子陈玄风、梅超风，俩人学艺未成，却暗中相爱，又担心被师父发觉性命不保，就偷偷逃离桃花岛。陈玄风走时自知武功卑微，在江湖上防身有余，成名不足，于是将黄药师视为至宝的《九阴真经下卷》偷走，两人急于求成，功夫愈练愈邪，把本来可以修炼成的正门武功摧心掌练成了毒掌。

后来到了明朝中期，青城派余沧海使用了摧心掌，这让很多人感到迷惑，《九阴真经》下册的摧心掌跟青城派的摧心掌到底有什么关系。